从审计开始到审计结束的全过程，与手工审计一样，分为三个阶段：即准备阶段、实施阶段和终结阶段。

准备阶段 需要确定审计对象，明确审计内容、要求、任务及目标，要熟悉被审计单位计算机信息系统的基本情况，制定审计方案和审计计划。

实施阶段 按计算机信息系统运行的次序逐项进行审查。首先，通过分析计算机信息系统中的各种控制制度，对系统进行详细调查，对系统的内部控制制度、系统的设计、系统的组织结构以及系统的运行及其处理结果进行检查，揭示其薄弱环节和漏洞，并提出改进意见;其次，要对计算机信息系统的软件设计方案进行审查，看其设计方案、程序和方法是否符合 ......